Protein–RNA interactions for Protein: Q96J01

THOC3, THO complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOC3Q96J01 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THOC3Q96J01 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THOC3Q96J01 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
THOC3Q96J01 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
THOC3Q96J01 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THOC3Q96J01 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
THOC3Q96J01 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THOC3Q96J01 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms