Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFRP2Q96HF1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms