Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SHISA4Q96DD7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHISA4Q96DD7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms