Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF21AQ96BD5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF21AQ96BD5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF21AQ96BD5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF21AQ96BD5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF21AQ96BD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF21AQ96BD5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF21AQ96BD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF21AQ96BD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF21AQ96BD5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF21AQ96BD5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF21AQ96BD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF21AQ96BD5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms