Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTPBP3Q969Y2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTPBP3Q969Y2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3Q969Y2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.5 ms