Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB1CQ92928 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms