Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRPF31Q8WWY3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF31Q8WWY3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.6 ms