Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM239Q8WW34 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM239Q8WW34 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TMEM239Q8WW34 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TMEM239Q8WW34 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM239Q8WW34 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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