Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH3RF3Q8TEJ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH3RF3Q8TEJ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH3RF3Q8TEJ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms