Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACVR1CQ8NER5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACVR1CQ8NER5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACVR1CQ8NER5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1CQ8NER5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms