Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C17orf47Q8NEP4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf47Q8NEP4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms