Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2CD4AQ8NCU7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C2CD4AQ8NCU7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms