Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC63Q8NA47 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms