Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MFSD2AQ8NA29 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD2AQ8NA29 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD2AQ8NA29 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms