Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX31Q8N9S9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX31Q8N9S9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX31Q8N9S9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX31Q8N9S9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX31Q8N9S9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX31Q8N9S9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX31Q8N9S9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX31Q8N9S9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX31Q8N9S9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX31Q8N9S9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX31Q8N9S9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX31Q8N9S9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX31Q8N9S9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms