Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC89Q8N998 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC89Q8N998 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms