Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINQ8N4C6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NINQ8N4C6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms