Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACE1Q8IYU2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACE1Q8IYU2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms