Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LOXHD1Q8IVV2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LOXHD1Q8IVV2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LOXHD1Q8IVV2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LOXHD1Q8IVV2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LOXHD1Q8IVV2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LOXHD1Q8IVV2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LOXHD1Q8IVV2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LOXHD1Q8IVV2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LOXHD1Q8IVV2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LOXHD1Q8IVV2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LOXHD1Q8IVV2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LOXHD1Q8IVV2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LOXHD1Q8IVV2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LOXHD1Q8IVV2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms