Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUQ4

SIAH1, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH1Q8IUQ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SIAH1Q8IUQ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIAH1Q8IUQ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIAH1Q8IUQ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIAH1Q8IUQ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms