Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y37

CACUL1, CDK2-associated and cullin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACUL1Q86Y37 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACUL1Q86Y37 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CACUL1Q86Y37 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms