Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SKAP1Q86WV1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SKAP1Q86WV1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SKAP1Q86WV1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms