Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LIMS2Q7Z4I7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LIMS2Q7Z4I7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIMS2Q7Z4I7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIMS2Q7Z4I7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms