Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X8

PGBD2, PiggyBac transposable element-derived protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD2Q6P3X8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD2Q6P3X8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD2Q6P3X8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD2Q6P3X8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms