Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETMD1Q6P1Q0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms