Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG9BQ674R7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG9BQ674R7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms