Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZFYVE27Q5T4F4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFYVE27Q5T4F4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms