Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VARS2Q5ST30 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VARS2Q5ST30 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VARS2Q5ST30 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms