Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD4BQ5PRF9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms