Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPECC1Q5M775 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPECC1Q5M775 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms