Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12AQ5D1E8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12AQ5D1E8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms