Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNI3KQ59H18 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNI3KQ59H18 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNI3KQ59H18 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNI3KQ59H18 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNI3KQ59H18 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNI3KQ59H18 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNI3KQ59H18 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNI3KQ59H18 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNI3KQ59H18 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNI3KQ59H18 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNI3KQ59H18 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNNI3KQ59H18 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNNI3KQ59H18 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNI3KQ59H18 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms