Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf17Q53FE4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf17Q53FE4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4orf17Q53FE4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms