Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q1T7F1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q1T7F1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q1T7F1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q1T7F1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q1T7F1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q1T7F1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q1T7F1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q1T7F1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q1T7F1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q1T7F1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q1T7F1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q1T7F1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q1T7F1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q1T7F1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q1T7F1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q1T7F1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q1T7F1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q1T7F1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q1T7F1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q1T7F1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q1T7F1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q1T7F1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q1T7F1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q1T7F1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q1T7F1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q1T7F1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q1T7F1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q1T7F1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Q1T7F1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Q1T7F1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q1T7F1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q1T7F1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q1T7F1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q1T7F1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q1T7F1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q1T7F1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q1T7F1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q1T7F1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q1T7F1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q1T7F1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q1T7F1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q1T7F1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q1T7F1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q1T7F1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q1T7F1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q1T7F1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q1T7F1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q1T7F1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q1T7F1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q1T7F1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q1T7F1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q1T7F1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q1T7F1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q1T7F1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q1T7F1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q1T7F1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q1T7F1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q1T7F1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q1T7F1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q1T7F1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q1T7F1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q1T7F1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q1T7F1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q1T7F1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q1T7F1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q1T7F1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q1T7F1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q1T7F1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q1T7F1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q1T7F1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q1T7F1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q1T7F1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q1T7F1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q1T7F1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q1T7F1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q1T7F1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q1T7F1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q1T7F1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q1T7F1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q1T7F1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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