Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNXAQ16473 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNXAQ16473 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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