Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXT1Q16394 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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EXT1Q16394 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXT1Q16394 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
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EXT1Q16394 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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EXT1Q16394 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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