Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF1CQ15572 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1CQ15572 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1CQ15572 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms