Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SQLEQ14534 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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