Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
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UBE4AQ14139 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBE4AQ14139 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
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UBE4AQ14139 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
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UBE4AQ14139 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
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UBE4AQ14139 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
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UBE4AQ14139 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
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UBE4AQ14139 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBE4AQ14139 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBE4AQ14139 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBE4AQ14139 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBE4AQ14139 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBE4AQ14139 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBE4AQ14139 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
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