Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE1CQ14123 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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