Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIRBPQ14011 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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