Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TCIRG1Q13488 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TCIRG1Q13488 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
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