Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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