Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CD164Q04900 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CD164Q04900 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CD164Q04900 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CD164Q04900 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CD164Q04900 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CD164Q04900 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CD164Q04900 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CD164Q04900 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD164Q04900 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD164Q04900 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD164Q04900 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD164Q04900 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD164Q04900 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD164Q04900 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD164Q04900 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CD164Q04900 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD164Q04900 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD164Q04900 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD164Q04900 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CD164Q04900 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CD164Q04900 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD164Q04900 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD164Q04900 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD164Q04900 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CD164Q04900 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CD164Q04900 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CD164Q04900 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CD164Q04900 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CD164Q04900 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CD164Q04900 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CD164Q04900 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CD164Q04900 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CD164Q04900 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CD164Q04900 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD164Q04900 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD164Q04900 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD164Q04900 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD164Q04900 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD164Q04900 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD164Q04900 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD164Q04900 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD164Q04900 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD164Q04900 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD164Q04900 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CD164Q04900 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD164Q04900 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD164Q04900 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD164Q04900 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD164Q04900 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD164Q04900 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD164Q04900 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD164Q04900 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD164Q04900 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD164Q04900 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD164Q04900 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD164Q04900 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD164Q04900 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD164Q04900 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD164Q04900 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD164Q04900 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms