Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APBA1Q02410 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APBA1Q02410 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.1 ms