Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUD4Q01804 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUD4Q01804 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms