Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3F3AP84243 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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