Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUCB2P80303 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUCB2P80303 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms