Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHC1P78364 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHC1P78364 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHC1P78364 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHC1P78364 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHC1P78364 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHC1P78364 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHC1P78364 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHC1P78364 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHC1P78364 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHC1P78364 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHC1P78364 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHC1P78364 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHC1P78364 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHC1P78364 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHC1P78364 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHC1P78364 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PHC1P78364 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHC1P78364 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHC1P78364 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHC1P78364 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHC1P78364 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHC1P78364 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHC1P78364 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHC1P78364 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHC1P78364 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHC1P78364 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHC1P78364 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHC1P78364 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHC1P78364 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHC1P78364 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHC1P78364 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHC1P78364 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHC1P78364 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHC1P78364 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHC1P78364 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHC1P78364 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC1P78364 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC1P78364 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC1P78364 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC1P78364 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC1P78364 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC1P78364 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC1P78364 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC1P78364 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC1P78364 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC1P78364 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC1P78364 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC1P78364 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC1P78364 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC1P78364 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC1P78364 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC1P78364 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC1P78364 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC1P78364 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC1P78364 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHC1P78364 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHC1P78364 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHC1P78364 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHC1P78364 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHC1P78364 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHC1P78364 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHC1P78364 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHC1P78364 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHC1P78364 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHC1P78364 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHC1P78364 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHC1P78364 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHC1P78364 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHC1P78364 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHC1P78364 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHC1P78364 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHC1P78364 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHC1P78364 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHC1P78364 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC1P78364 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC1P78364 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC1P78364 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC1P78364 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC1P78364 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC1P78364 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC1P78364 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC1P78364 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC1P78364 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHC1P78364 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHC1P78364 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms