Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P63132 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P63132 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms